Gruppe Zaborsky
Klonale Heterogenität und Immunveränderungen bei Krebserkrankungen
Forschungsthematik
Das TEAM Zaborsky nutzt verschiedene Einzelzell-Techniken um Krebszellen und deren Interaktionen mit Immunzellen zu untersuchen. Neben der Tumorheterogenität und der klonalen Evolution von Krebszellen wird auch das Therapieansprechen im Patienten und im Mausmodell analysiert sowie dessen Zusammenhang mit dem Darmmikrobiom.
Unsere Schwerpunkte
- Klonaler Evolution und Tumorheterogenität (single-cell genomics)
- Anti-Krebs-Immunität und Interaktionen zwischen Immunzellen
- Immun-Phänotypisierungen
- Wechselwirkung zwischen Darmmikrobiota und Immunzellen
- Therapieansprechen und Resistenzmechanismen
Maligne Zellen stehen in ständiger Interaktion mit Immunzellen, wodurch ein wechselseitiger Selektionsdruck entsteht, der die subklonale Krebsevolution prägt und zu einer spezifischen Veränderung der Zusammensetzung der Immunzellen führt, die über Erfolg oder Misserfolg von Immunüberwachung und Therapien entscheidet.
Tumorheterogenität und klonale Evolution
Die chronische lymphatische Leukämie (CLL), eine sehr häufige B-Zell-Leukämie älterer Menschen, ist gekennzeichnet durch die Anhäufung von nicht-funktionalen B-Zellen in Lymphknoten und peripherem Blut. Hochdurchsatz-Sequenzierungsansätze an mehreren Krebsentitäten haben komplexe genetische Landschaften in menschlichen Krebserkrankungen offenbart. Auch für die CLL wurde ein komplexes Set von klonalen und subklonalen Mutationen beschrieben. Die Heterogenität von Tumoren kann eine wichtige Rolle bei der Diagnose und Behandlung von Krebs spielen sowie entscheidend für das Ansprechen auf Behandlungen sein.
Besseres Verständnis der Krebs-Immun-Interaktionen
Um Einblicke in die komplexe Tumorbiologie zu erhalten, verwenden wir unterschiedliche Mausmodelle. Dafür verwenden wir unter anderem das CLL-Mausmodell (TCL1tg) um die Reorganisation des Mikromilieus und das Ansprechen auf Immuntherapien zu untersuchen. Dabei interessieren wir uns auch für CLL-Immun-Interaktionen in unterschiedlichen Organen. Durch die phänotypische und funktionelle Charakterisierung von (potentiell Tumorantigen-spezifischen) T-Zelle wollen wir die Anti-Krebs-Immunantwort bei CLL besser verstehen und versuchen Immunzellen zu reaktivieren.
„Die Untersuchung von Krebs-Immun-Interaktionen ist von größter Bedeutung, nicht nur um die Krebsprogression und die Immunevasion zu verstehen, sondern auch um die aktuellen Immun-Checkpoint-Therapieansätze zu verbessern, die – obwohl sie als Durchbruch in der Krebstherapie gelten – bei CLL und einigen anderen Krebsentitäten nicht wirksam sind.“
Priv.-Doz. Dr. Nadja Zaborsky
Darmmikrobiota und dessen Wechselwirkungen mit Immunzellen
Da das Darmmikrobiota für das Ansprechen auf Immuntherapien entscheidend ist, untersuchen wir die taxonomische Zusammensetzung im Krebspatienten und in verschiedenen Mausmodellen. Zusätzlich interessieren wir uns auch für die Wechselwirkung des Mikrobiota mit den unterschiedlichen Immunzellen im Darm. Ein besseres Verständnis dieses Zusammenspiels könnte in Zukunft dafür genutzt werden, die Zusammensetzung des Darmmikrobiotas zu modulieren, um das Ansprechen der Patienten auf Immuntherapien zu verbessern.
Bildgebende Massenzytometrie an Immunzellen im Dünndarm.
Bildgebende Massenzytometrie: leukämieinfiltrierter Lymphknoten (links) und CLL frei nach Behandlung (rechts).
In this lab, WE BELIEVE
https://sammykatta.com/diversity (adapted with biorender)
Team
Nadja Zaborsky
(Group leader)
https://orcid.org/0000-0002-9775-185X
Thomas Parigger
(Post-Doc)
Aryunni Abu Bakar
(PhD student)
Stephan Drothler
(PhD student)
Christian Scherhäufl
(PhD student)
Jan Höpner
(PhD student)
Omar Mohamed
(Master student)
News:
CCS-CLL Workshop 2023
Publikationen
Parigger T, Gassner FJ, Scherhäufl C, Bakar AA, Höpner JP, Hödlmoser A, Steiner M, Catakovic K, Geisberger R, Greil R, Zaborsky N. Evidence for Non-Cancer-Specific T Cell Exhaustion in the Tcl1 Mouse Model for Chronic Lymphocytic Leukemia. Int J Mol Sci. 2021 Jun 22;22(13):6648. doi: 10.3390/ijms22136648.
Steiner M, Gassner FJ, Parigger T, Neureiter D, Egle A, Geisberger R, Greil R, Zaborsky N. A POLE Splice Site Deletion Detected in a Patient with Biclonal CLL and Prostate Cancer: A Case Report. Int J Mol Sci. 2021 Aug 30;22(17):9410. doi: 10.3390/ijms22179410.
Parigger T, Greil R, Zaborsky N. Mouse models to decipher anti-tumor immunity. Oncotarget. 2019 Aug 20;10(49):5005-5006. doi: 10.18632/oncotarget.27111. eCollection 2019 Aug 20.
Zaborsky N, Gassner FJ, Höpner JP, Schubert M, Hebenstreit D, Stark R, Asslaber D, Steiner M, Geisberger R, Greil R, Egle A. Exome sequencing of the TCL1 mouse model for CLL reveals genetic heterogeneity and dynamics during disease development.Leukemia. 2019 Apr;33(4):957-968. doi: 10.1038/s41375-018-0260-4.
Zaborsky N, Gassner FJ, Asslaber D, Reinthaler P, Denk U, Flenady S, Hofbauer JP, Danner B, Rebhandl S, Harrer A, Geisberger R, Greil R, Egle A. CD1d expression on chronic lymphocytic leukemia B cells affects disease progression and induces T cell skewing in CD8 positive and CD4CD8 double negative T cells. Oncotarget. 2016 Aug 2;7(31):49459-49469. doi:10.18632/oncotarget.10372.
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